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VarScore 基因变异评分系统

AI 驱动的临床变异解读平台:自动阅读文献、提取证据,ACMG/AMP 分级,SNP·SV·ROH 全覆盖

AI 文献阅读 · 证据提取ACMG/AMP 分级SNP · SV · ROH本地 Ensembl VEP多预测器整合批量 VCF · PDF 报告
VarScore 基因变异评分系统 — SNP 解读:ACMG 优先布局,准则勾选与分级实时重算
产品概述

VarScore 基因变异评分系统能做什么

VarScore 基因变异评分系统是一款 AI 驱动的商业级临床变异解读平台,对标 Franklin / Genoox 的核心工作流。其最前沿的能力是让 AI 自动检索并阅读海量医学文献、从论文中提取结构化的致病性证据并映射到 ACMG 准则,把原本最耗时的文献复核变成分钟级的智能辅助。平台提供 ACMG/AMP 合规的变异致病性分级,覆盖 SNP、结构变异(SV)与纯合区域(ROH)三类解读流程,整合本地 Ensembl VEP 注释与多源数据,并支持社区共识、批量 VCF 分析与 PDF 报告,帮助实验室更快、更准、更一致地完成变异解读。

AI
文献证据提取
28
ACMG 准则
3 类
SNP·SV·ROH
440万
ClinVar
核心能力

为真实场景而生的能力

AI 文献阅读与证据提取

最核心、最前沿的能力:AI 自动检索并阅读相关医学文献,从论文中提取功能实验、家系共分离、病例与从头突变等关键证据,结构化映射到 ACMG 准则(如 PS3/BS3、PP1、PS2),让耗时的文献复核变成分钟级智能辅助。

ACMG/AMP 交互式分级

遵循 Richards 2015 标准,SNP 全 28 条 ACMG 准则、SV 覆盖 ClinGen 2020 CNV 1-5 节,准则可逐条勾选、调整强度并实时重算分级。

SNP · SV · ROH 三类流程

三套独立解读模板:SNP(ACMG 优先)、SV(ACMG + 区域浏览)、ROH(基因与区域优先),各自匹配解读场景。

区域浏览器 6 数据轨

基因、剂量敏感性(ClinGen)、ClinVar 收录、DGV Gold、DGV 与 gnomAD SV 多轨可视化,变异置于基因组上下文中解读。

多预测器证据整合

聚合 REVEL、AlphaMissense、SpliceAI、EVE、PrimateAI 等致病性预测器,并整合 gnomAD 群体频率与基因级约束(pLI/LOEUF)。

批量分析与报告

支持最多 200 条变异的批量 VCF 分析、分类持久化、社区共识对比与 PDF 报告导出。

AI 文献证据工作流 · 实例演示

一条变异,五步得到带出处的证据

把临床专家最耗时的「读文献、找证据、对准则」环节交给 AI——每条证据都可追溯到原文出处。

输入变异MYH7 NM_000257.4:c.1750G>C (p.Glu584Lys) 〔示例〕
1
解析变异标准化坐标 / HGVS / 基因
2
检索文献命中 23 篇相关研究
3
全文阅读大模型理解实验与病例
4
证据抽取结构化 6 条关键证据
5
映射 ACMG对齐准则并给出分级
PS3强 · 功能实验证据
体外功能实验显示蛋白功能受损

AI 摘要:ATP 酶活性与肌动蛋白结合显著降低。 文献来源〔示例〕

PS2强 · 从头突变
先证者经双亲验证为新发变异

AI 摘要:父母均未携带且亲缘关系已验证。 病例报告〔示例〕

PP1支持 · 家系共分离
家系内与表型共分离

AI 摘要:一个家系 3 名受累成员均携带。 家系研究〔示例〕

PM2支持 · 群体频率
群体数据库中极低频 / 缺失

AI 校验:gnomAD 未见收录,符合 PM2。 gnomAD(自动)

证据组合自动汇总(PS3 + PS2 + PP1 + PM2)→ ACMG 分级建议Likely Pathogenic(可能致病)

〔示例数据,仅作能力演示〕每条证据均链接到原文出处,支持人工复核、调整准则强度并实时重算分级——AI 负责「读与找」,判读权仍在专家手中。

产品界面

真实界面,一看即懂

VarScore 基因变异评分系统 — SNP 解读:ACMG 优先布局,准则勾选与分级实时重算
SNP 解读:ACMG 优先布局,准则勾选与分级实时重算
VarScore 基因变异评分系统 — 结构变异(SV):ClinGen CNV 分级 + 区域浏览器多数据轨
结构变异(SV):ClinGen CNV 分级 + 区域浏览器多数据轨
VarScore 基因变异评分系统 — 纯合区域(ROH):基因与区域优先,基因致病性卡片展开
纯合区域(ROH):基因与区域优先,基因致病性卡片展开
为什么选择它

关键优势

AI 文献证据引擎自动阅读文献、抽取证据并对齐 ACMG 准则——把专家最耗时的环节交给 AI。
对标 Franklin / Genoox复刻商业平台核心解读工作流,能力对齐并更进一步。
多预测器整合REVEL、AlphaMissense、SpliceAI、EVE、PrimateAI 等一站聚合。
家系与从头突变证据de novo(PS2/PM6)、共分离(PP1/BS4)证据带实时重分类。
技术规格

规格一览

AI 证据引擎文献检索 + 阅读 + 结构化证据提取 → ACMG 准则映射
分级标准ACMG/AMP 2015(SNP 28 条)· ClinGen 2020 CNV(SV)
变异注释本地 Ensembl VEP 112 · 多源注释
致病性预测REVEL · CADD · AlphaMissense · SpliceAI · EVE · PrimateAI
参考数据ClinVar · gnomAD · DGV · dbNSFP · GTEx · ClinGen · Ensembl
查询格式坐标 chr9-135800978-A-G · HGVS · rsID · SV · 芯片记法
坐标转换hg19 ↔ hg38 liftover
常见问题

关于VarScore 基因变异评分系统

VarScore 基因变异评分系统是什么?

VarScore 是一款 AI 驱动的商业级临床变异解读平台,对标 Franklin/Genoox 工作流,提供 ACMG/AMP 合规的变异致病性分级,覆盖 SNP、结构变异(SV)与纯合区域(ROH)解读,并以 AI 自动阅读文献、提取证据为核心能力。

VarScore 的 AI 文献证据功能具体能做什么?

面对一个变异,VarScore 的 AI 会自动检索并阅读相关医学文献,从论文中抽取功能实验、家系共分离、病例报告与从头突变等关键证据,并结构化映射到对应的 ACMG 准则(如 PS3/BS3、PP1、PS2),同时给出可溯源的文献出处,让原本数小时的文献复核缩短到分钟级。

支持哪些变异类型和 ACMG 准则?

SNP 解读实现 ACMG 2015 全 28 条准则(含 PVS1、PM1、PS2/PM6、PP1/BS4、BP7 等);结构变异遵循 ClinGen 2020 CNV 1-5 节评分;ROH 采用基因与区域优先的专用布局。

整合了哪些致病性预测与参考数据?

整合 REVEL、AlphaMissense、SpliceAI、EVE、PrimateAI、dbscSNV 等多种 in-silico 预测器,并聚合 ClinVar、gnomAD、DGV、dbNSFP、GTEx、ClinGen 等参考数据与群体频率,辅助 ACMG 判读。

支持哪些查询格式与批量分析?

支持基因组坐标(chr9-135800978-A-G)、HGVS、rsID、SV 坐标与芯片记法等多种查询格式,并支持最多 200 条变异的批量 VCF 分析与 PDF 报告导出。

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